> ggbeast_🧬.md
Porque o FigTree é legal, mas o ggplot2 é vida. Um pacote R para você parar de sofrer com os logs do BEAST 2 e focar na ciência.
Visualizando o Tempo Evolutivo
Entender a dinâmica populacional ao longo do tempo é um dos pilares da biologia evolutiva. O ggbeast foi desenvolvido para facilitar a visualização de resultados complexos vindos de análises do software BEAST2, trazendo a flexibilidade do ggplot2 para o mundo da filogenética e demografia histórica.
Por que o ggbeast é útil?
Muitas vezes, interpretar e visualizar os arquivos de saída (log e trees) de softwares bayesianos pode ser uma tarefa árdua. O ggbeast automatiza a leitura e a geração de gráficos como o Extended Bayesian Skyline Plot (EBSP), permitindo que você visualize as mudanças no tamanho efetivo da população (Ne) através do tempo geológico de forma clara e profissional.
Destaques Técnicos
- EBSP Simplificado: Plote seus resultados de demografia histórica com apenas alguns comandos.
- Poder do ggplot2: Aplique temas, cores e escalas customizadas de forma nativa.
- Reprodutibilidade: Facilita o compartilhamento e a recriação de figuras para publicações científicas.
Como instalar e usar
Você pode instalar a versão de desenvolvimento diretamente do GitHub:
remotes::install_github("wilsonfrantine/ggbeast")
library(ggbeast)
# Gerar o gráfico EBSP principal
# Altere o caminho abaixo para o seu arquivo .log do BEAST
p1 <- ggebsp("caminho_para_seu_arquivo_log")
# Visualize e customize como qualquer outro ggplot
p1 + theme_minimal() + labs(title = "Dinâmica Populacional Histórica")O ggbeast é uma ferramenta ágil para o pesquisador que precisa converter resultados estatísticos complexos em narrativas visuais impactantes sobre a evolução biológica.